專業級組織流式定量分析系統

    StrataQuest作為專業級組織流式定量分析平臺，整合HistoQuest/TissueQuest軟件提供的組織原位單細胞水平精準定量分析解決方案。該軟件兼容多種類型組織細胞樣本，實現不同生物科研領域的原位定量分析，更深層次的分析需求。

StrataQuest軟件能夠精準識別復雜組織中的：

分子探針標記（FISH、RNA Scope等）

細胞亞水平結構標記物（細胞器、細胞骨架等）

單細胞結構標記（細胞核、細胞質、細胞膜等）

特殊組織類型（如腺體、腫瘤、血管、支氣管、肌肉、骨等）

技術特點

組織結構自動識別

基于神經網絡與深度學習的單細胞識別算法

AI人工智能組織特質化數據挖掘

細胞亞型的空間位置分布

多靶點組織微環境蛋白分子互作

可視化大數據多維度分析

基于神經網絡(DNN)與深度學習的單細胞識別算法

    2020年，TissueGnostics公司在專業單細胞核識別算法基礎上，結合深度神經網絡算法（Deep Neural Networks，DNN），開發了新一代基于AI的單細胞核識別方法，不但可以更準確分辨互相擠壓重疊的細胞核，而且對于細胞輪廓邊界識別，排除了非焦面的模糊邊界帶來的不確定性，提高了細胞核/質/膜形態學識別的準確率。（左圖為常規細胞核識別算法，右圖為基于神經網絡(DNN)與深度學習的單細胞識別算法）

特異性組織結構的形態學識別

    特異性組織區域識別解決方案，適用于明場/熒光樣本。對于彩色明場樣本，可自動獨立細胞核/質/膜染色通道：1. 利用蘇木素/DAPI染色通道，對細胞核進行精準識別，繼而定量細胞核/質/膜信號強度分布及面積形態；2. 利用特異性染色及組織特征，識別上皮細胞/間質區域/空腔等結構，對腫瘤/腺體/膠原增生等組織類型進行識別及定量分析。該解決方案還可用于HE染色樣本的細胞-組織結構識別，使大量樣本快速染色+深度分析的工作模式成為可能。

AI人工智能組織特質化數據挖掘

    作為專業大數據組織流式深度分析軟件，StrataQuest整合了不同算法模塊，通過標記-訓練-修正的人機交互模式，能夠精確獲得符合不同實驗需求的組織結構輪廓及其定量分析數據。同時TG公司也針對不同研究目的開發了一系列APP解決方案，實現了更多研究者對于軟件高效、易于操作的使用需求。

新版StrataQuest Classifier算法獲得的組織識別結果，也同樣支持與其他算法模塊聯動，如反卷積運算、集合運算、布爾運算等等，以實現創新研究中更為精準復雜的定量分析要求。

基于細胞-組織社會學的數據驅動研究

    細胞社會學是研究細胞社會性的科學，即通過研究細胞間識別、通訊、集合的的模式，對細胞與細胞、細胞與組織乃至整個機體的相互依存、相互制約、相互作用的關系進行研究，包含細胞對組織功能的影響，以及整體和細胞群對細胞的生長、分化和死亡等活動的調節控制。

    StrataQuest頂級定量分析軟件細胞-組織社會學分析功能，通過細胞識別及特異性結構識別、組織識別功能，可以獲得：1. 目標在組織原位的數量關系、面積大小、形態學參數；2. 細胞-細胞、細胞-組織、組織-組織之間微米級的空間位置關系；3. 目標特異性染色的強度、分布、統計關系

    利用TissueFAXS Cytometry二維散點圖正反向回溯校驗技術，對三者從數據層面和圖像層面的數據進行有機整合，獲得組織原位細胞社會學的大數據分布規律。

    該功能源自TissueGnostics公司在歐盟CaSR Biomedicine項目中開發的數字病理頂級科研需求。該項目是通過利用單個分子鈣敏感受體（CaSR）來影響一系列的生理和疾病過程，從而開發出獨特，強大的多學科和跨部門的科學。項目由八個國家的13個研究小組團體合作，采用系統生物學方法來研究糖尿病、阿爾茨海默氏病、肌肉減少癥、癌癥、心血管疾病中，相同的細胞分子在不同組織中的重要性。通過研究來確定靶向CaSR的藥物的新穎治療方法。

組織微環境原位精準定量分析

    生物體原位，不同的組織器官和構成其微環境的多種因素共同作用，發揮著不同的功能。通過哪些特征指標可以更精準的判定微環境范圍和結構，以及微環境中不同因素量化的客觀標準，直接影響科學研究的策略及數據的可靠性。以腫瘤微環境為例，腫瘤可以通過釋放細胞信號分子影響其微環境，促進腫瘤的血管生成和誘導免疫耐受，而微環境中的免疫細胞可影響癌細胞增長和發育，有助于腫瘤異質性的形成，腫瘤微環境中的免疫細胞組成常常會決定其對某種特定療法的響應，尤其是會決定癌癥免疫療法的成敗。

    StrataQuest專業組織流式定量分析軟件根據識別到的腫瘤輪廓，結合實驗需要，實現以微米為尺度尋找腫瘤內外不同距離范圍內目的細胞的功能?？啥x的識別的標準包括核/質/膜的各種形態及染色，也可以包括雙標/三標乃至無上限標記數量的共表達目的細胞。通過精確定量微環境中發揮不同功能的特定細胞及其位置，找到不同實驗組中的差異趨勢。

    利用StrataQuest軟件發表的相關文章中，已有研究者證明腫瘤能夠誘導腫瘤相關巨噬細胞、髓系來源的抑制細胞和調節性T細胞等的形成，進而在腫瘤微環境中誘導免疫抑制，促進腫瘤免疫逃逸，并且促進腫瘤的侵襲轉移。因此，這些細胞類群也作為潛在的藥物靶點來干預腫瘤的發生發展。

多種數據呈現模式

    TissueFAXS Cytometry組織流式定量分析技術提供多種可選數據呈現模式（細胞真實輪廓圖、散點圖、直方圖、熱力圖及原始數據等）。在TissueFAXS Cytometry二維類流式散點圖與組織原位定量細胞進行實時對應校驗的基礎上，新增了細胞影像散點圖，不但可以在散點圖象限內獲得真實細胞的直觀分布趨勢，更可以獲得所有目標細胞在組織中的整體表現，便于研究者從整體水平對細胞組織定量標準進行把控。